1、腸道菌群失調(diào)
臨床上主要表現(xiàn)為泡沫盲腸糞便、橙色糞便和大灘盲腸糞便；雞只可能存在“勾料”（將顆粒飼料甩出料盤），“料糞”（糞便中出現(xiàn)未被消化的飼料）；飲水量增加。

發(fā)生菌群失調(diào)時，肉雞生產(chǎn)性能或不受影響，或使采食量減少，進(jìn)而影響生長；腳病較常見。使用抗生素藥物后，有時稀便可恢復(fù)正常，但以后的整個生長期內(nèi)仍然易感，不能形成永久免疫力，病因不除，仍會復(fù)發(fā)。
2、病毒性因素
多與輪狀病毒和呼腸孤病毒有關(guān)。
3、球蟲病
在肉雞的整個養(yǎng)殖過程中，球蟲病一直是最普遍的影響腸道健康和生長效率的重要疾病之一，而感染球蟲后所引發(fā)的腸道病原菌感染，也是引發(fā)腸道疾病的重要原因。
4、壞死性腸炎
引起壞死性腸炎的因素很多，但產(chǎn)氣莢膜梭狀芽孢桿菌是導(dǎo)致壞死性腸炎的一種普遍存在的厭氧性微生物。當(dāng)肉雞感染亞臨床型球蟲病，飼料中淀粉和蛋白質(zhì)的含量過高，使用部分小麥、大麥和燕麥等代替玉米作為能量飼料等情況下，產(chǎn)氣莢膜梭狀芽孢桿菌能在腸道中繁殖，產(chǎn)生毒性較強(qiáng)、肉雞敏感的α毒素而致病。
5、霉菌毒素蓄積性中毒
霉菌毒素正在逐步加重對我國肉雞的威脅。霉菌的污染，一般多見飼料、環(huán)境的污染。飼料污染最常見的是玉米的污染，其次是豆粕、雜粕的污染，然后是食槽內(nèi)的污染和成品料的污染。霉菌及其毒素的污染，對雞的各個系統(tǒng)各個組織都能造成損害，尤其是消化系統(tǒng)。如肌胃潰爛、腺胃腫大、腸粘膜脫落、腸道菌群失調(diào)等；臨床表現(xiàn)就是拉稀、拉不消化飼料糞便。

我國養(yǎng)雞行業(yè)中流行的腺胃炎、肌胃腺胃炎，基本上都是由目前霉菌及其毒素引起的。

但是，由于飼料霉變因素?zé)o法徹底排除，因而商品肉雞要經(jīng)常面臨腸道不健康，消化系統(tǒng)功能不全的現(xiàn)狀。

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